Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HRCP23327 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HRCP23327 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HRCP23327 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HRCP23327 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HRCP23327 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HRCP23327 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HRCP23327 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HRCP23327 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HRCP23327 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms