Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSR1P21757 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSR1P21757 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSR1P21757 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms