Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD247P20963 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD247P20963 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD247P20963 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms