Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD53P19397 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD53P19397 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD53P19397 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD53P19397 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms