Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT4P19013 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT4P19013 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT4P19013 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT4P19013 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT4P19013 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT4P19013 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT4P19013 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT4P19013 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT4P19013 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT4P19013 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT4P19013 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT4P19013 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT4P19013 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms