Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms