Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSPP15924 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSPP15924 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSPP15924 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSPP15924 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms