Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2F2P13984 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms