Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms