Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TYMSP04818 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TYMSP04818 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TYMSP04818 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TYMSP04818 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TYMSP04818 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TYMSP04818 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TYMSP04818 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TYMSP04818 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms