Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms