Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSTAP01040 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSTAP01040 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSTAP01040 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms