Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBX7O95931 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX7O95931 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX7O95931 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX7O95931 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms