Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTBP3O95758 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms