Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F6O75461 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F6O75461 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F6O75461 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F6O75461 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F6O75461 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F6O75461 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F6O75461 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms