Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms