Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms