Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FRS3O43559 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FRS3O43559 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRS3O43559 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRS3O43559 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRS3O43559 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRS3O43559 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRS3O43559 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FRS3O43559 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FRS3O43559 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FRS3O43559 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms