Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms