Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM6AO15550 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms