Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2O14595 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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