Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TULP1O00294 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TULP1O00294 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TULP1O00294 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP1O00294 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP1O00294 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP1O00294 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP1O00294 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP1O00294 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP1O00294 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP1O00294 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP1O00294 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TULP1O00294 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TULP1O00294 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP1O00294 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TULP1O00294 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms