Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRRM5B3KS81 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SRRM5B3KS81 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms