Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms