Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB19A4D1S5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms