Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms