Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDD3Q9Y3P4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms