Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP3Q9Y2W7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms