Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms