Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms