Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms