Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CROTQ9UKG9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms