Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF221Q9UK13 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms