Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms