Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms