Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP25Q9UHP3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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