Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms