Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms