Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPG2Q9UBF2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms