Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RRBP1Q9P2E9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RRBP1Q9P2E9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms