Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCC2Q9P258 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms