Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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VSX1Q9NZR4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX1Q9NZR4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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