Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms