Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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