Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP3Q9NS15 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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