Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FANCFQ9NPI8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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