Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms