Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP4F12Q9HCS2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F12Q9HCS2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms