Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTD2Q9H8S5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms