Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MIXL1Q9H2W2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms